Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
NPTX1Q15818 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms