Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CYTH1Q15438 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CYTH1Q15438 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.7 ms