Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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SNX17Q15036 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SNX17Q15036 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SNX17Q15036 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SNX17Q15036 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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SNX17Q15036 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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SNX17Q15036 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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SNX17Q15036 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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SNX17Q15036 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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