Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms