Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCINQ13939 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CCINQ13939 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CCINQ13939 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
CCINQ13939 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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