Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
NAE1Q13564 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NAE1Q13564 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NAE1Q13564 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NAE1Q13564 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NAE1Q13564 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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NAE1Q13564 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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NAE1Q13564 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NAE1Q13564 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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NAE1Q13564 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NAE1Q13564 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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