Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMED1Q13445 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms