Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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