Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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