Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCGQ13326 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.4 ms