Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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