Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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