Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRGP23470 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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PTPRGP23470 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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PTPRGP23470 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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PTPRGP23470 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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PTPRGP23470 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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PTPRGP23470 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
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PTPRGP23470 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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PTPRGP23470 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
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