Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTIFO43310 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTIFO43310 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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