Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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