Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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