Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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