Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZBED9Q6R2W3 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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