Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IMPG1Q17R60 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
IMPG1Q17R60 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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