Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms