Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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ZFHX3Q15911 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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