Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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VAMP3Q15836 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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VAMP3Q15836 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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VAMP3Q15836 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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VAMP3Q15836 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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VAMP3Q15836 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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VAMP3Q15836 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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