Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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