Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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