Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms