Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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