Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NFIXQ14938 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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