Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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CAPRIN1Q14444 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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CAPRIN1Q14444 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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