Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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