Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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