Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms