Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CSTF3Q12996 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CSTF3Q12996 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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CSTF3Q12996 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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CSTF3Q12996 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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CSTF3Q12996 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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CSTF3Q12996 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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