Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms