Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms