Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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CHCHD4Q8N4Q1 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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CHCHD4Q8N4Q1 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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CHCHD4Q8N4Q1 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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