Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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