Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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PTPROQ16827 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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PTPROQ16827 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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PTPROQ16827 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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PTPROQ16827 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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