Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
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LAMA3Q16787 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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