Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
NREPQ16612 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
NREPQ16612 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NREPQ16612 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NREPQ16612 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NREPQ16612 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
NREPQ16612 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms