Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SYPL1Q16563 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYPL1Q16563 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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