Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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