Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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