Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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