Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms