Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD1Q15797 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms