Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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ALX1Q15699 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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ALX1Q15699 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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ALX1Q15699 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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ALX1Q15699 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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ALX1Q15699 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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ALX1Q15699 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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