Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
TAF1AQ15573 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TAF1AQ15573 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms