Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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