Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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GPNMBQ14956 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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