Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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